ChemCraft ChemCraft — это графическая программа на базе Windows для работы с квантово-химическими вычислениями. Это удобный инструмент для визуализации результатов вычислений и подготовки новых заданий для расчета. ChemCraft в основном разработан как графический пользовательский интерфейс для пакетов программ Gamess (версия для США) и Gaussian. Для работы с другими форматами расчетов удобно использовать возможность импорта/экспорта координат атомов в текстовом формате. ChemCraft не выполняет собственных расчетов, но может значительно облегчить использование широко распространенных пакетов квантовой химии. Программа сочетает в себе продвинутый графический интерфейс пользователя и полезные функции, предназначенные для практического использования. ChemCraft обеспечивает очень подробную структурированную визуализацию выходных файлов, основанную на разделении файла на отдельные элементы и представлении их в виде иерархического многоуровневого списка; эта функция позволит легко анализировать сложные файлы, такие как задания IRC, задания сканирования или вычисления с несколькими заданиями. Графический движок ChemCraft не требует аппаратного ускорения. Вот некоторые ключевые особенности «ChemCraft»: 1. Отрисовка трехмерных изображений молекул по координатам атомов с возможностью просмотра или изменения любого геометрического параметра в молекуле (расстояние, угол); 2. Визуализация выходных файлов Gamess или Gaussian: представление отдельных геометрий из файла (оптимизированная структура, геометрия на каждом шаге оптимизации и т. д.), анимация колебательных режимов, графическое представление градиента (силы на ядрах), визуализация молекулярных орбиталей в форма изоповерхностей или окрашенных плоскостей, визуализация колебательных или электронных (например, TDDFT) спектров, возможность отображения графика сходимости SCF и некоторые другие возможности; 3.Различные инструменты для построения молекул и модификации молекулярной геометрии: использование стандартных молекулярных фрагментов, «перетаскивание» атомов или фрагментов по изображению молекулы, утилита для задания группы точек и другие возможности; 4. Создание готовых к публикации изображений молекул в настраиваемых режимах отображения, содержащих необходимые обозначения (метки, линии и т.д.); 5. Некоторые дополнительные утилиты для подготовки входных файлов: визуальное построение Z-матриц, автоматическая генерация входных файлов с нестандартными базисными наборами, преобразование МО, считанных из выходного файла, в формат входного файла. Ограничения: 1. 90-дневная пробная версия 2. Предоставляется только исходный код FORTRAN для американской версии Gamess. 3. Нет возможности связать ChemCraft с другими программами для ввода/вывода химических расчетов. Скачать: Приложение ChemCraft представляет собой мощный и интуитивно понятный вычислительный интерфейс для визуализации всех расчетов квантовой химии. Его можно использовать в терминале или включить в текстовый процессор для визуализации выходных файлов. Первая версия программы с интерфейсом для пакета Gaussian была представлена в 2007 году на конференции Тверского академического центра «Ново» в Твери, а первая версия с интерфейсом для Gamess была представлена на конференции МКА «Ностра Днепра» в Днепровский научный центр в 2009 году. Программа поддерживает следующие три пакета квантовой химии: Gaussian 03, Jaguar и Gamess. Все три являются коммерческими продуктами. Gamess распространяется в виде программы "Майкрософт". Jaguar распространяется в виде отдельной условно-бесплатной программы; его можно бесплатно загрузить из Интернета. Gaussian 03 распространяется только в виде условно-бесплатного ПО. Алгоритм гамма-ориентационного механизма квантово-химических расчетов был изобретен в 1995 г. (в лаборатории С. А. Шарова Университета Риеки). Этот механизм реализован в программе Fmf, которая разработана в институте НЮМИАТРУД (Ереван, Армения) и распространяется на интернет-ресурсе «Нагапацик.нет». Использование механизма гамма-ориентации реализовано в ChemCraft в следующих двух режимах: ￭ Режим «Гамма-виб» основан на механизме гамма-ориентации квантово-химических вычислений. Результатам расчетов можно придать вариант нахождения в частотной области (с возможностью отображения графика вибрации). ￭ «Гамма-моды» основаны на механизме гамма-ориентации. Результаты расчетов могут быть представлены в виде режима колебаний или списка оптимизированных структур молекулы с возможностью отображения режима колебаний; Помимо визуализации, программа также позволяет просматривать рассчитанные спектры и оптимизировать структуру молекулы. Программа может генерировать файлы изображений с запрошенной информацией. ChemCraft имеет встроенный молекулярный редактор 3D/2D, а также широко используемую программу просмотра 3D/2D изображений. Преимущества приложения: ￭ Результаты вычислений можно получить, нажав на соответствующие значения (в Скриншоте); ￭ Результаты вычислений могут fb6ded4ff2
Related links:
Comments